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侯学煜的主要著作有:
侯学煜,中国境内酸性土钙质土和盐碱土的指示植物,中国科学院,1952年
侯学煜,中国境内酸性土钙质土和盐碱土的指示植物,科学出版社,1954年
侯学煜,植物生态地理学的内容任务概念和研究方法,科学出版社,1956年
侯学煜,贵州省及其邻近地区的蕨类植物生态环境的初步观察(植物生态学与地植物学资料丛刊第14号),科学出版社,1957年
侯学煜、林厚萱、章彗麟,中国150种植物的化学成分及其分析方法,高等教育出版社,1959年
侯学煜 编著,中国的植被,人民教育出版社,1960年
侯学煜,中国植被地理及优势植物化学成分,科学出版社,1982年
侯学煜 供稿编写,初级中学课本植物学教学挂图——我国的植物群落,上海教育出版社,1983年
侯学煜,中国自然生态区划与大农业发展战略,科学出版社,1988年
侯学煜,中国自然地理 植物地理(下册)(中国植被地理),科学出版社,1988年
植被生态学研究编辑委员会,植被生态学研究——纪念著名生态学家侯学煜教授,科学出版社,1994年
侯学煜,1:1 000 000 中国植被图集,中国地图出版社,2001年